軍方權威官員透露，
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，配合國軍精粹案組織改造，
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，軍情局將有重大變革，
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，未來情報業務將改由參謀本部聯二情報次長室督導，
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，不再是國安局負責，
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，此外，
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，電技室的偵監單位則併入國防部電展室，
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，同時將官員額將由現行十一位，精簡至五、六位將官。
軍方消息管道指出，軍情局現雖隸屬參謀本部，但實際卻有兩個老闆，人事由參謀本部管轄，情報業務卻歸國安局督導，國安局長甚至可以影響軍情局長乃至高階情報幹部調動，配合精粹案，國防部決定完全收回軍情局的人事與情報督導權，並責由聯二情報次長室負責。
據了解，前參謀總長湯曜明時代也曾想收回軍情局的主導權，並規定重大情報未經參謀本部同意，不能逕自呈報國安局，為此湯曜明與時任國安局長殷宗文頗有較勁，後經協調，始又回歸情報歸國安局督導，人事歸國防部管制的默契，但歷任軍情局長與高階情報人事，均視國防部長與國安局長其在總統與國安會祕書長的分量而定，有時是國安局長定奪，有時是國防部長，如現任局長湯家坤係國防部長高華柱決定，上任局長張戡平則由國安局長蔡得勝推舉。
至於軍情局電技室，現已搬至新店的溪園，負責大陸電訊攔截破譯，本來前警總的監聽設備也併入電技室，但馬英九總統上任後堅持不做非法監聽，電技室任務功能萎縮，且與國防部電展室相近，而績效卻遠不如電展室，因此，電技室未來將併入電展室，期發揮電訊偵監的整合力量。
軍情局將官員額也將大幅精簡至個位數，並規畫處長職務由少將降編為上校。據了解，軍情局將官員額在一九九六年台海危機時為高峰，達二十二位之多，現則精簡至十一、二位，配合國防部精粹案，明年底將精簡至五、六位，此外，軍情局設立的復興電台也將併入由國防部政戰局主導的漢聲電台。，