《兩岸服務貿易協議》遭批評，
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，經濟部次長卓士昭表示，
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，由於未來還會有更多ＦＴＡ談判進行，
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，經濟部將建立標準作業流程（ＳＯＰ），
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，並研議要求受諮商業者、立委等簽署保密協定，
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，以利在保密與適度公開資訊之間取得平衡。
卓士昭說，
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，台紐經濟合作協定（ＡＮＺＴＥＣ）簽署後，
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，對正在與台灣洽商類似議議的其他國家產生示範效果，目前台灣與印度、印尼進行的自由貿易協定（ＦＴＡ）可行性研究進行相當順利，菲律賓也開始跟進，政府將依經濟部訂定的ＦＴＡ路徑圖逐一推動。
卓士昭昨被問到ＡＮＺＴＥＣ簽署後，下一波簽署經濟協議對象國是誰，卓士昭回答，馬英九總統曾提及，台灣與各國簽署ＦＴＡ類似協定的步調落後很多，經濟部訂有洽談自由貿易協定的「路徑圖」，在提報行政院策略小組同意後，目前正根據此一路徑圖逐一進行。
卓士昭同時透露，我國主要競爭對手韓國正與大陸洽談ＦＴＡ，但兩岸兩岸貨品貿易協議談判的進展，較中韓ＦＴＡ要快。
而兩岸服貿協議遭批評談判過程過於保密，卓士昭解釋，包括美國在內的所有國家，在談ＦＴＡ時「都是當機密在處理」。以ＡＮＺＴＥＣ為例，去年五月展開協商時，紐方便要求絕對保密，紐方與該國業界、國會議員諮商時，也要求簽保密協定。
卓士昭說，考量未來還有更多談判要進行，包括馬上要完成的兩岸貨品貿易談判，與其他國家的自由貿易談判，經濟部將建立一套標準作業程序，例如被諮商對象簽署保密協議，以使國內疑慮減到最少。，