十二年國教政策即將於明年正式上路，
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，但其中免學費方案爭議仍僵持不下。立法院預算中心評估報告提出示警，
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，十二年國教相關經費逾六成用於免學費方案，
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，經費分配過於懸殊，
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，不僅恐產生預算排擠效應，
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，更無助均衡教育資源，
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，不符社會公平正義精神。
根據立院預算中心「一○二年度中央政府總預算案整體評估報告」指出，
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，有關十二年國教實施計畫，
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，教育部今年度共編列二八八．九六億元，其中以免學費方案所需經費最高，高中職免學費編列一四二．七六億元，學前教育免學費四二．七七億元，共計一八五．五三億元，占總經費比例高達六四．二一％。
相較於居次的高中職優質化及均質化相關經費僅四二．一二億元，還不到兩成；技職教育與產業發展更低於一成，只有二五．一八億元；國中教學正常化、適性輔導及品質提升等項目也只分到十九．九二億元。其餘工作項目或配套措施經費各年度占總需求比率大多低於二％。
報告並指出，政府推動十二年國教仍無專屬財源，中央及地方政府財政狀況日益困窘，教育經費增加勢必將排擠其他政事支出成長空間；加上一○四年度十二年國教經費需求估計數高達三六八．四七億元，屆時恐將造成明顯的預算排擠效應。
預算中心也指出，十二年國教配套措施也未排列優先順序，政府率先推出的全面性免學費，其所需經費各年度比例皆逾六成，一○四年度更高達二四八．四六億元，導致經費分配偏重於免學費方案，壓縮其他配套措施預算的編列空間。
預算中心抨擊，全面免學費不符社會公平正義原則，每年度編列百億經費，卻未能縮短城鄉教學品質差距，無助於均衡城鄉教育資源、確保國中學生基本素質，資源配置之妥適性令人存疑。
免學費方案以高中職免學費所需經費最龐大，每年度皆逾一百億元，自一○三學年度起則不分公私立學校，學費皆全額補助。免學費案雖以減輕家長負擔為出發點，卻忽略各級學校教學資源差異，僅採「齊頭式平等」，無法使教育資源均衡分配。，