面對中國（上海）自由貿易試驗區可能對台灣造成的影響，
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，兩岸多位學者在一場研討會上建議，
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，上海自貿區與台灣的自由經濟示範區可先進行「微型市場」的交流對接，
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，但重點不是「區與區」合作，
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，而是趁此找到兩岸產業分工的模式。但大陸學者也提醒，
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，在進入戰略合作的同時，
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，也突顯兩岸互信的重要性。
由上海社會科學院台灣研究中心與浦東台灣經濟研究中心舉辦的「上海自貿區與兩岸關係發展研討會」，
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，上海台辦主任李文輝表示，
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，上海自貿區在2014年就要創造出首批可複製、給其他地方借鑒的經驗模式，
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，目前也在研究是否增加對台資企業的吸引力度。
11家台企完成入駐
據上海市台辦最新統計，目前已有11家台資企業在自貿區完成註冊，註冊資金總額350.67萬美元，包括8家貿易公司、2家諮詢公司以及1家電子材料公司，李文輝表示，第一銀行已在辦手續，國泰世華、土地銀行等業者都在為設立支行作準備。
有機遇、也是挑戰，政治大學財經系主任黃智聰就表示，若上海自貿區金融澈底對外開放，台灣僅以ECFA為賣點、吸引外商投資的誘因將相對變少，屆時將威脅台灣成為亞太財富管理、籌資中心的目標。
在貨運方面，他認為高雄港和基隆港將面臨邊緣化，且滬自貿區的概念是開放給國際的，所以兩岸合作，不能僅是「區和區」，還是要以兩岸整體產業來看。
宏觀布局 避惡性競爭
中國社科院台灣研究所副所長張冠華認為，兩岸跟一般區域合作不同，不是取消關稅就可以了，到底如何分工，產官學都要有制度，以宏觀的總體布局，才能避免局部的惡性競爭。兩岸要進入戰略合作，將涉及資本、併購等，還要充分照顧兩岸的產業需求，不管是政治、經濟、或是產業間，沒有互信是不行的。
張冠華建議自貿區與自經區合作，有「微型市場」的效果，先在這種「特區」進行政策對接，一旦達到標準，就可放鬆進入二線的條件，以零關稅進入雙方境內市場。
上海東亞研究所副所長鍾焰也認為，上海自貿區如果要合作，一定要有整合平台、共同海外投資、以及經濟運營、政策協調等功能，成為「綜合性多元化功能平台」。
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