為解決離島的自來水供水問題，
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，經濟部水利署決興建澎湖的馬公烏崁，
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，及金門等地的海水淡化廠（簡稱海淡廠）。其中，
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，該署擬在馬公烏崁砸下約8億元，
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，發包興建每日4，
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，000噸海淡廠，
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，最快103年以後動工興建。
另外，
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，水利署也規畫在大金門擴建每日2，
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，000噸海淡廠，
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，及更新每日2，000噸海淡廠，總工程金額約4億元，預定103年發包。此外，水利署已動用2，600萬元，擴充馬祖東引每日250噸的海淡廠，目前工程已完工，正在驗收中。目前該署還在馬祖地區進行樂道沃水庫及紫沃水庫工程，均預定102年6月完工。
水利署透露，馬公烏崁海淡廠占地面積2公頃，目前正進行環評，一旦全案順利通過，將由政府出資，並依採購法發包，委託統包廠負責興建與營運，預定103年以後動工興建，106年底前完工，之後再由統包廠營運15年。
目前已營運的馬公烏崁海淡廠，包括擴建每日5，500噸海淡廠，及每日7，000噸海淡廠更新改善案，兩者合計每日產水量達1萬噸，若再加上新增烏崁海淡廠加入後，當地將規畫一處占地10公頃的海淡園區，不僅可解決澎湖馬公的供水問題，還可提供觀光休閒，及帶動海淡產業的發展。
水利署說，未來馬公烏崁每日4，000噸海淡廠加入後，推估澎湖地區107年每日供水能力，可由目前約3.42萬噸（含海淡廠、地下水，及湖庫水），再提高至3.78萬噸，之後可減抽馬公地下水每日2，000噸，讓澎湖地區在110年之前，每日供水能力可達3.54萬噸，可滿足澎湖地區110年3.39萬噸的用水需求。
至於金門地區供水，水利署指出，101年金湖水庫啟用後，可增供水量2，138噸，約達每日規畫供水量3，054噸的7成。等105年底，完成大金門海淡廠功能改善暨擴建工程之後，未來大金門每日供水量，可再增供3，000噸，完工後，統包商可營運20年。
另在金門興建營山淨水廠，最快105年可加入，屆時金門每日供水能力，可提升至3.5萬噸，與當地110年「中成長每日用水需求」約3.59萬噸，約有每日853噸的供水缺口。
水利署說，金門地區供水，除了有雨水利用地下水補注、湖庫水收集、營山淨水場高級淨水處理，及大金門海淡廠功能改善暨擴建工程完成外，未來還須規畫興建2.5萬噸的大型海淡廠或規畫境外引水接續上場之後，才可具體改善金門供水及地下水超抽問題。，