內政部駁回南投縣長李朝卿的復職申請，
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，讓李質疑未審先判。不過，
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，內政部昨天表示，
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，李朝卿案起訴書有許多縣府的公務員作證、自白，
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，加上所涉犯罪情節重大、複雜，
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，不得已才援用《公務人員懲戒法》移送監察院並繼續停職。
南投縣代理縣長的副縣長陳志清昨指稱，
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，內政部可依《地方制度法》，准或不准李朝卿復職；但援引《公務員懲戒法》卻是荒腔走板！
陳志清說，依《公務員懲戒法》第四條二款規定的移送、停職懲處，是「主管長官對於所屬公務員」關係，據此，李鴻源的「主管長官」是行政院長江宜樺，李鴻源的「所屬公務員」是內政部員工。但是，李鴻源是各縣市長的主管長官嗎？
內政部法規會執秘劉文仕指出，在《公懲法》第三條中規定「當然停職」的事由，在《地制法》中已構成解職，為了避免兩法發生適用爭議，所以《地制法》才規定地方行政首長停職排除適用《公懲法》第三條；然而，這並不表示《地制法》必須完全排除《公懲法》適用，內政部仍可援引《公懲法》第四條的規定，依職權將李朝卿停職。
內政部次長蕭家淇坦言，中央對地方人事監督權的行使，除非有必要，否則應優先適用《地制法》；若輕易動用《公懲法》將民選地方首長停職，會嚴重傷害地方自治；因此內政部過去處理縣市首長申請復職案均依《地制法》批准，無關藍綠，而是謹守權力自我節制的法制要求。
劉文仕表示，李朝卿申請復職案，內政部原先未將《公懲法》列入考慮，但取得李朝卿的起訴書後，發現李所涉犯行重大複雜，且縣府公務員在調查過程中對李朝卿有諸多指控及自白，幾經考量才決定援引《公懲法》繼續予以停職。，